生物系翟继先课题组在《PNAS》发表论文阐述大数据挖掘在植物表观遗传组学中的应用
日期:2018-01-19
2018年1月17日,我校生物系副教授翟继先课题组与美国加州大学Steven Jacobsen教授课题组合作在国际著名权威杂志《Proceedings of the National Academy of Sciences》(《PNAS》)在线发表了题为 “Large-scale comparative epigenomics reveals hierarchical regulation of non-CG methylation in Arabidopsis” 的研究论文。南方科技大学植物食品所和生物系为本项研究工作第一单位,校长卓越博士后基金资助者张雨为本文共同第一作者,翟继先为论文通讯作者。
近年随着测序技术的不断完善,生物领域积累了大量基因组、转录组、表观组学数据。怎样有效利用这些数据挖掘生物学新知识,是研究工作者在大数据时代面临的挑战。该研究以DNA甲基化测序数据入手,探索了大数据挖掘揭示生物学新知识的研究之路。翟继先课题组重新分析了公共数据库中来自不同实验室的约500余组Col-0型拟南芥DNA甲基化数据:通过比较单个突变体和多个野生型,鉴定了每个突变体中高置信度的DNA甲基化差异区域,进而分析了不同突变体间DNA甲基化差异区域的重合度,揭示控制DNA甲基化相关基因之间的联系。

不同突变体DNA甲基化差异区域重合度的聚类分析
我校博士后龙艳萍、博士后肖丽丹、博士生冯丽以及实验助理陈旭参与了该研究的部分工作。
本项目得到了国家自然科学基金、广东省创新创业团队、南方科技大学校长卓越博士后等基金的资助。
文章链接:http://www.pnas.org/content/early/2018/01/10/1716300115.full
最新动态
-
南科大翟继先团队与合作者发布小鼠泛器官Poly(A)尾图谱
Date:2026-05-11
-
Cell | 南科大郭红卫团队揭示乙烯受体感知内质网氧化还原状态的新机制
Date:2026-04-28
-
“南科春色知多少”校园动植物科普讲解志愿活动圆满举行 ——生科院、致新书院与校园讲解志愿服务队共建,本研协同助力校园科普
Date:2026-04-20
-
国内外顶尖学者共聚南科大,共话脂质信号转导与细胞代谢新前沿
Date:2026-04-16