阿卜杜拉国王科技大学(KAUST)计算机科学系高欣教授到访生物系进行学术交流
日期:2017-01-16
2017年01月16日,阿卜杜拉国王科技大学(KAUST)计算机科学系的高欣教授应我校生物系陈炜教授的邀请来南科大进行学术交流,并开展了题为《Quantitative understanding of protein interactions through data mining and machine learning》的学术讲座。
高欣教授的研究领域为生物信息学,主要研究方向为使用数据挖掘与机器学习的方法,研究不同蛋白质与其他生物分子的相互作用与调控动态网络。其研究成果已在Bioinformatics, Nucleic Acids Research, ACS Synthetic Biology, BMC Genomics等多个杂志发表。 讲座从介绍如何应用生物信息学的技术手段研究蛋白质与生物分子的相互作用开始,首先介绍了如何使用domain预测与序列分析进行蛋白质结构与相互作用的研究。对于这一方面,高欣教授重点介绍了其实验室开发的iDTP计算工具。iDTP能够根据已知的药物与蛋白质相互作用,预测药物可能的新作用蛋白靶点。
接着,高欣教授介绍了其实验室在转录因子的网络调节与分子调节上的工作。在这方面的研究中,其实验室运用新的优化手段,使用深度学习的计算机分析技术,能够定量地描述转录因子调控后,靶RNA与靶蛋白表达水平的动态变化,以及这一过程中关键的参数。 这些高水平工作以及细致的讲座,使得在座的南科大师生了解了生物信息学在现代生物学研究中的作用,令大家感受到了这个领域的重要性,并产生了浓厚的兴趣。在讲座的最后,大家与高欣教授进行了热烈的学术讨论和交流。
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