题 目：Chromatin Looping Mechanism in Human Cells

主 讲：阮一骏 教授

时 间：2026年4月10日（周五）下午16:20-17:30

地 点：琳恩图书馆111报告厅

报告摘要：

Cohesin is crucial for establishing 3D genome organization and functions. However, the in vivo mechanism of cohesin-mediated extrusion remains unsettled. We investigated extrusion directionality using integrated genome mapping coupled with perturbation in human cells. By defining cohesin loading at NIPBL binding loci and anchoring at CTCF sites, we systematically characterized the aggregated and single-molecule trajectories of extrusion “stripes” and contact “dots” from and between individual cohesin loading and anchoring points. Our analyses delineated two dynamic modes of in vivo mechanism in which NIPBL/cohesin initiates extrusion at its loading sites in a ‘one-sided’ manner; after encountering CTCF, cohesin switches its extrusion direction backward and robustly extrude DNA unidirectionally until completing the convergent CTCF loop. Surprisingly, depleting CTCF resulted substantial increase of NIPBL/cohesin-mediated extrusion activity, which is further validated by in silico perturbation. These findings reveal novel mechanistic insights into how cohesin and CTCF orchestrate cohesin-mediated loop extrusion in vivo.

嘉宾简介：

阮一骏 博士，浙江大学求是讲席教授、生命科学研究院首席研究员、浙江大学附属第二医院特聘教授、中国遗传学会三维基因组学专委会首届主任。其主要研究方向是以结构决定功能的第一性理念来探讨索人类基因组三维空间的动态结构与基因转录调节功能的因果关系。迄今共发表研究和综述评论文章160余篇，包括多篇在Cell、Nature、Science等杂志中发表的高水平学术论文。

阮一骏教授毕业于华中农业大学，于美国马里兰大学获得分子生物学博士学位，曾先后任职于美国孟山都公司基因组学高级科学家、加州瓦卡维尔大型生物公司基因组学部门主任、新加坡国立基因组研究院副院长及基因组学技术部主任。加入浙江大学之前，任职于美国康涅狄格州大学医学健康中心遗传学及基因组学系终身教授、美国杰克逊实验室Florine Deschenes Roux冠名讲席教授和基因组学及计算生物学部主任。 阮一骏教授曾获得多项荣誉，包括新加坡国家最高科学奖、中国国家级高层次人才、浙江省资深鲲鹏学者等。

阮一骏教授是开发二代DNA测序应用技术的先驱者，也是三维基因组学研究领域的奠基人之一，并在ENCODE和4DN等重大国际项目中发挥关键作用。阮教授团队近期的研究重点是持续探索三维基因组学在单细胞单分子层面上的研究方法以及在广泛的生物学包括生物医学问题中的应用。