课题组简介

南方科技大学翟继先课题组（集贤斋）成立于2016年7月，位于“中国的硅谷”—深圳。“集贤斋”专注于表观遗传学领域的研究，结合三代测序、单细胞技术和大数据分析方法，研究动植物中转录调控和发育中一系列重要问题。2016年领导独立课题组后，已经以通讯作者和共同通讯作者在Nature Plants（2篇）、The Plant Cell（2篇）、Molecular Plant、Nature Protocols、Genome Biology（2篇）、Plant Biotechnology Journal（2篇）以及PNAS等知名期刊上发表论文16篇。目前是植物学杂志Plant Physiology和Plant Molecular Biology副主编，还是20多个植物学和生物信息学领域专业期刊的审稿人。

实验室主页：http://www.jixianzhai.org/。

课题组研究方向

1）第三代全长转录组学。

2）单细胞转录组学。

3）植物表观组学。

招聘要求

1）国内外知名高校分子生物学、生物信息学相关专业博士学位。

2）与课题组长共同制定研究计划，开展课题研究。

3）协助课题组培养硕士/博士研究生。

4）英语水平优秀。

5）有第一作者或共同第一作者的学术论文者优先。

薪资待遇

1）博士后聘用期两年，年薪33万元起，含广东省生活补贴15万元及深圳市生活补贴6万元，并按深圳市有关规定参加社会保险及住房公积金。博士后福利费参照学校教职工标准发放。

2）特别优秀候选人可以申请校长卓越博士后，年薪可达50万元以上（含广东省及深圳市在站生活补贴）。

3）在站期间，可依托学校申请深圳市公租房，未依托学校使用深圳市公租房的博士后，可享受两年税前2800元/月的住房补贴。

4）拥有优良的工作环境和境内外合作交流机会，博士后在站期间享受两年共计2.5万学术交流经费资助。

5）课题组协助符合条件的博士后申请“广东省海外人才支持项目”。即在世界排名前200名的高校（不含境内，排名以上一年度泰晤士、USNEWS、QS和上海交通大学的世界大学排行榜为准）获得博士学位，在广东省博士后设站单位从事博士后研究，并承诺在站2年以上的博士后，申请成功后省财政给予每名进站博士后资助60万元生活补贴（与广东省及深圳市在站博士后生活补贴不同时享受）；对获得本项目资助，出站后与广东省用人单位签订工作协议或劳动合同，并承诺连续在粤工作3年以上的博士后，省财政给予每人40万元住房补贴。

6）博士后出站选择留深从事科研工作，且与本市企事业单位签订3年以上劳动（聘用）合同的，可以申请深圳市博士后留深来深科研资助。深圳市政府给予每人每年10万元科研资助，共资助3年（以深圳市最新申报要求为准）。

7）根据《深圳市新引进博士人才生活补贴工作实施办法》规定，新引进博士人才生活补贴（10万元）与省市博士后在站生活补贴不同时享受。

申请材料

1）详细的个人简历 （含学习、工作/科研经历、科研成果、发表论文、联系方式和所受奖励）。

2）2-3推荐人的姓名及有效联系方式（至少一人为学位导师）。

3）其他可以证明工作能力的材料。

应聘方式

应聘者请将申请材料发送至课题组负责人邮箱zhaijx@sustech.edu.cn。

课题组已发表论文（*co-first author, #Corresponding author）：

植物转录调控及单细胞转录组：

Qin Y, Long Y, Zhai J#. (2022) Genome-wide characterization of nascent RNA processing in plants. Current Opinion in Plant Biology. 69:102294.

Jia J*, Lu W*, Liu B, Fang H, Yu Y, Mo W, Zhang H, Jin X, Shu Y, Long Y, Pei Y, Zhai J#. (2022) An atlas of plant full-length RNA reveals tissue-specific and monocots–dicots conserved regulation of poly(A) tail length. Nature Plants. doi.org/10.1038/s41477-022-01224-9.

Mo W*, Liu B*, Zhang H, Jin X, Lu D, Yu Y, Liu Y, Jia J, Long Y, Deng X, Cao X, Guo H, Zhai J# (2021) Landscape of transcription termination in Arabidopsis revealed by single-molecule nascent RNA sequencing. Genome Biology. 22(1):322.

Long Y*, Liu Z*, Jia J*, Mo W, Fang L, Lu D, Liu B, Zhang H, Chen W, Zhai J#. (2021) FlsnRNA-seq: protoplasting-free full-length single-nucleus RNA profiling in plants. Genome Biology. doi.org/10.1186/s13059-021-02288-0.

Long Y*, Jia J*, Mo W, Jin X, Zhai J#. (2021) FLEP-seq: simultaneous detection of RNA polymerase II position, splicing status, polyadenylation site and poly(A) tail length at genome-wide scale by single-molecule nascent RNA sequencing. Nature Protocols. 16:4355–4381.

Jia J*, Long Y*, Zhang H, Li Z, Liu Z, Zhao Y, Lu D, Jin X, Deng X, Xia R, Cao X, Zhai J#. (2020) Post-transcriptional splicing of nascent RNA contributes to widespread intron retention in plants. Nature Plants. 6(7):780-788.

小RNA及表观组学：

Lu D*, Feng L*, Zhai J, Li B#, Xi M# (2022) Safeguard DCL2-Dependent 22-nt siRNA generation by DCL1. Biochemical and Biophysical Research Communications. 605, 97-103.

Li Z*, Long Y*, Yu Y, Zhang F, Zhang H, Liu Z, Jia J, Mo W, Tian SZ, Zheng M, Zhai J# (2022) Pore-C simultaneously captures genome-wide multi-way chromatin interaction and associated DNA methylation status in Arabidopsis. Plant Biotechnol Journal. 20(6):1009-1011.

Lu D, Zhai J#, Xi M# (2022) Regulation of DNA methylation during plant endosperm development. Frontiers in Genetics. 13:760690.

Hu D*, Yu Y*, Wang C*, Long Y, Liu Y, Feng L, Lu D, Liu B, Jia J, Xia R, Du J, Zhong X, Gong L, Wang K#, Zhai J#. (2021) Multiplex CRISPR-Cas9 editing of DNA methyltransferases in rice uncovers a class of non-CG methylation specific for GC-rich regions. Plant Cell. 33(9):2950-2964.

Yu Y, Zhai J#. (2020) The chromatin will never forget. Nature Plants. doi.org/10.1038/s41477-020-00803-y.

Jia J*, Ji R*, Li Z, Yu Y, Nakano M, Long Y, Feng L, Qin C, Lu D, Zhan J, Xia R, Meyers BC, Liu B#, Zhai J#. (2020) Soybean Dicer-Like 2 regulates seed coat color via production of primary 22-nt small interfering RNAs from long inverted repeats. Plant Cell. 32(12):3662-3673.

组学大数据分析：

Yu Y*, Zhang H*, Long Y, Shu Y, Zhai J# (2022) Plant Public RNA-seq Database: a comprehensive online database for expression analysis of ~45 000 plant public RNA-Seq libraries. Plant Biotechnol Journal. 20, 806-808.

Zhang H*, Zhang F*, Yu Y*, Feng L, Jia J, Liu B, Li B, Guo H, Zhai J#.(2020) A comprehensive online database for exploring ∼20,000 public Arabidopsis RNA-Seq libraries. Molecular Plant. 13(9):1231-1233.

Feng L*, Zhang F*, Zhang H, Zhao Y, Meyers BC, Zhai J#. (2020) An online database for exploring over 2,000 Arabidopsis small RNA libraries. Plant Physiology. 182(2):685-691.

Yu Zhang*, Jake Harris*, Qikun Liu*, Wanlu Liu, Israel Ausin, Yanping Long, Lidan Xiao, Li Feng, Xu Chen, Yubin Xie, Xinyuan Chen, Lingyu Zhan, Suhua Feng, Jingyi Jessica Li, Haifeng Wang#, Zhai J#, and Steven E. Jacobsen#. (2018) Large-scale comparative epigenomics reveals hierarchical regulation of non-CG methylation in Arabidopsis. PNAS. 115 (5) E1069-E1074.